Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 4930428N03Rik-201ENSMUST00000038250 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 A530064D06Rik-201ENSMUST00000027764 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Snora17-201ENSMUST00000104004 132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm17163-201ENSMUST00000152043 432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm2693-201ENSMUST00000189119 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 1700019A23Rik-201ENSMUST00000208842 196 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm15738-205ENSMUST00000210378 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC133947.1-201ENSMUST00000213336 614 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC165265.1-201ENSMUST00000225929 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC137117.2-201ENSMUST00000228560 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tnp1-201ENSMUST00000027374 437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr1222-201ENSMUST00000099794 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm13481-201ENSMUST00000127672 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Trim34a-203ENSMUST00000106849 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Agtr1b-201ENSMUST00000068316 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Msl3-202ENSMUST00000112137 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 S100a16-203ENSMUST00000107331 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm12493-201ENSMUST00000150111 441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm20540-201ENSMUST00000172972 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC158603.2-201ENSMUST00000219191 315 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm31126-201ENSMUST00000222366 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm6116-201ENSMUST00000101121 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Elavl2-203ENSMUST00000107109 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Elavl2-205ENSMUST00000107111 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Eif3l-201ENSMUST00000040518 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 2210408F21Rik-205ENSMUST00000138606 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm12305-201ENSMUST00000151817 407 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm7083-201ENSMUST00000178617 450 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 Gm4257-201ENSMUST00000222877 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2bQ01097 AC144949.1-201ENSMUST00000225358 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms