Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm24432-201ENSMUST00000104075 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm15050-201ENSMUST00000133723 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Kank3-204ENSMUST00000173789 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Scgb1b11-201ENSMUST00000186031 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Scgb1b18-201ENSMUST00000191255 402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 AC125350.3-202ENSMUST00000224295 457 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Cnpy4-202ENSMUST00000110934 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Hsd11b1-205ENSMUST00000161737 1355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm10629-201ENSMUST00000137706 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Zmynd11-202ENSMUST00000110633 1857 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Msl3-202ENSMUST00000112137 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm42553-201ENSMUST00000196390 1629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 1810021B22Rik-205ENSMUST00000162579 544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Zfp383-201ENSMUST00000186475 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm6088-201ENSMUST00000117257 2539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm16077-201ENSMUST00000121915 655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Tcl1b2-202ENSMUST00000142230 851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rpl6l-201ENSMUST00000171120 871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm3176-201ENSMUST00000200920 1249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gas2-209ENSMUST00000208711 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm37608-201ENSMUST00000195696 1880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm3244-201ENSMUST00000120938 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm15729-201ENSMUST00000125829 360 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 BC048671-202ENSMUST00000167550 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm38390-201ENSMUST00000194859 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Gm7434-201ENSMUST00000208558 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Eif3g-201ENSMUST00000004206 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Olfr132-201ENSMUST00000087128 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cux1P53564 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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