Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Krt27Q9Z320 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt27Q9Z320 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt27Q9Z320 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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