Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Homer1Q9Z2Y3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Homer1Q9Z2Y3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms