Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms