Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1K5

Arih1, E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arih1Q9Z1K5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arih1Q9Z1K5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Arih1Q9Z1K5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arih1Q9Z1K5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms