Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nek4Q9Z1J2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nek4Q9Z1J2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nek4Q9Z1J2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms