Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Phf1Q9Z1B8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms