Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccl8Q9Z121 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccl8Q9Z121 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms