Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms