Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Extl3Q9WVL6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Extl3Q9WVL6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Extl3Q9WVL6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms