Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nme3Q9WV85 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nme3Q9WV85 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme3Q9WV85 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms