Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Stub1Q9WUD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Stub1Q9WUD1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Stub1Q9WUD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms