Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Skp1Q9WTX5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Skp1Q9WTX5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms