Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkraQ9WTX2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PrkraQ9WTX2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PrkraQ9WTX2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms