Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms