Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Exo1Q9QZ11 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Exo1Q9QZ11 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms