Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nphp1Q9QY53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nphp1Q9QY53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nphp1Q9QY53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms