Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx8Q9QXV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cbx8Q9QXV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx8Q9QXV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms