Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trip4Q9QXN3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trip4Q9QXN3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms