Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt17Q9QWL7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt17Q9QWL7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt17Q9QWL7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms