Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dkk3Q9QUN9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dkk3Q9QUN9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dkk3Q9QUN9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms