Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cnot9Q9JKY0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cnot9Q9JKY0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms