Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ldb3Q9JKS4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ldb3Q9JKS4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms