Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Scamp5Q9JKD3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scamp5Q9JKD3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scamp5Q9JKD3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms