Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnga3Q9JJZ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms