Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ercc6l2Q9JIM3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ercc6l2Q9JIM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms