Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ush1cQ9ES64 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ush1cQ9ES64 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ush1cQ9ES64 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms