Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp29Q9ES63 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp29Q9ES63 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp29Q9ES63 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms