Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Ndst3Q9EQH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndst3Q9EQH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Ndst3Q9EQH7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndst3Q9EQH7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndst3Q9EQH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ndst3Q9EQH7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Ndst3Q9EQH7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Ndst3Q9EQH7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Ndst3Q9EQH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Ndst3Q9EQH7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ndst3Q9EQH7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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