Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a3bpQ9EQG9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3bpQ9EQG9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3bpQ9EQG9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms