Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms