Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March8Q9DBD2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
March8Q9DBD2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
March8Q9DBD2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms