Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med27Q9DB40 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med27Q9DB40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms