Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc89Q9DA73 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc89Q9DA73 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms