Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9S1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D9S1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9S1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D9S1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D9S1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9S1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9D9S1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D9S1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms