Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp4bQ9D8B3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chmp4bQ9D8B3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms