Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
U2af1Q9D883 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2af1Q9D883 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2af1Q9D883 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms