Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmigd1Q9D7L8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmigd1Q9D7L8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms