Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn23Q9D7D7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn23Q9D7D7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn23Q9D7D7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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