Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MsraQ9D6Y7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MsraQ9D6Y7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MsraQ9D6Y7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms