Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gcc1Q9D4H2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gcc1Q9D4H2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms