Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc6Q9D4E6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc6Q9D4E6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc6Q9D4E6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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