Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pus10Q9D3U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pus10Q9D3U0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pus10Q9D3U0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms