Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pramef12Q9D2F1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pramef12Q9D2F1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef12Q9D2F1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms