Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mdm1Q9D067 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mdm1Q9D067 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms