Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nde1Q9CZA6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nde1Q9CZA6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nde1Q9CZA6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms