Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bud23Q9CY21 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
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Bud23Q9CY21 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Bud23Q9CY21 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bud23Q9CY21 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms