Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl11Q9CXW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl11Q9CXW4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms