Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gje1Q9CX92 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gje1Q9CX92 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms